手术室净化系统是通过净化空调机组对手术室内空气中所包含的尘埃粒子进行过滤，以阻拦空气中10微米以上及减少0.5微米以上尘埃颗粒进入手术间内影响并破坏净化空气。达到手术室内空气相对洁净的效果。
一、关于手术间内净化空气与细菌菌落的关系细菌都是在有附着物的情况下才得以生存的，空气中所含的尘埃颗粒也就是空气中细菌滋生的附着物。所以在经过净化后的洁净手术室内可以有效的遏制细菌滋生。洁净区经过净化的空气内适合细菌生存的大颗粒尘埃已被过滤掉，属于不利于细菌生存的环境，所以洁净手术间内也就不用再刻意的进行物理消毒。只需在手术前30分钟启动净化空调机组，对空气进行自净，就可以保证手术间内空气达到相应级别的净化程度。但对于污染手术术后手术床表面及有污物低落的地面，还是建议用消毒水进行处理。这样更能保证手术的安全性。
二、关于温度、湿度对净化及手术的影响
手术间内温度与湿度过高或过低，会直接影响到净化级别和手术的正常进行。
根据相关资料显示，室内温度在高于28度，湿度超过70%后，易造成霉菌的滋生，诱发创伤口的感染。同时操作人员也会因为闷热、出汗、烦躁、疲劳影响其安定的情绪和敏捷的思维，使操作者的技术水平不能得到很好的发挥。
室内温度低于20度时，因为操作者只穿手术衣会感觉到冷，可能会影响到动作的灵敏性和准确性。另外病人由于是创伤机体抵抗力处于低下水平。更易患感冒等并发症。
湿度过低空气过于干燥的环境，物体表面的浮尘容易随走动或铺单等动作漂浮在空中，可能会飘落到操作者的手上或者器械上对病人的创面感染造成威胁。所以建议手术间内温度保持在22度—25度之间、湿度保持在40%--60%之间。
三、关于净化空调的维护与保养
净化空调机组的维护与保养是否到位，直接影响到空调是否能正常使用，也就直接关系到洁净区的净化级别与温度、湿度是否达标。在手术间内空调温度与湿度不能控制在适宜范围内时，应及时通知维保人员，对空调系统进行检查，找出问题及时处理。以保证手术室的正常运行。
对于空调各级过滤器的更换，应当根据空气质量情况灵活掌握。在空气质量差，室外属于污染或重污染空气时，对过滤器的损坏较为严重，应当更换更勤些。一般新风粗效过滤网至少每月要更换一次、初效过滤器一般每月更换一次、中效过滤器每季度应更换一次、高效过滤器一般一年更换一次。另外，还应对加湿器及时进行维护，石家庄地区水质偏硬，易结水垢，应定期除垢。对程控系统也应定期检查，观察线路使用情况，是否有过载或老化。对线路板浮尘及时清理，防止短路。
四、关于洁净区管理的几点建议
洁净区日常管理应严格按照规范操作，如进入洁净区必须更衣换鞋，病人出入应执行换车程序，所产生的污物必须走污物通道等，经常对洁净区内卫生进行清扫，保持干净。另外，有长期不用的手术间，启用前必须对手术间内卫生进行一次清理。以防止室内空气过脏，过早的使空调过滤器受到破坏，减少使用寿命。